Ce n'est pas la première fois j'ai un bug étrange, après avoir laissé tourner l'ordinateur toute une nuit celui-ci devient lent et ne répond presque plus.
En effet j'ai pu constater avec la commande top que gnome-shell utilisait 80% de la mémoire + 100% du swap.
Après avoir tué le processus tout est revenu dans l'ordre (un alt+r aurait surement pu marcher également).
Je vais essayer de désactiver l'extension System monitor voir si il y a une différence
https://bugzilla.redhat.com/show_bug.cgi?id=977387